2022/09/20 / 公司活动及新闻
简单介绍下环状RNA
简单介绍下环状RNA
2022/09/20
环状RNA(circularRNA,circRNA)是一种特殊的非编号RNA分子,与传统线形RNA(linearRNA)不同的是,它是由反向剪接形成的封闭式RNA分子。circRNA没有5‘尾帽和3’尾帽poly(A)尾巴,根据外显子环化或内含子环化,将3‘和5’尾端相互连接,产生完整的环形结构,避免被核酸外切酶溶解,因此与线性相比RNA更稳定,更保守。RNA它在疾病中起着主导作用,特别是在癌症中,在疾病诊断和治疗对策的发展上具有独特的优势。
CircRNA发觉过程表
环状RNA形成
A:经典线形RNA切割方法:根据内容子中的内容子GU/AG序列,连接前后显子的首尾,完美RNA都有5‘短帽子结构和3’PolyA尾巴;
B:环状RNA切割方法:根据非特异反向切割,后显子的尾部与前显子的前端相连,无5短帽结构和3PolyA尾巴由一个或多个外显子组成,有些是圆形的RNA还包括内含子。
环状RNA的特征
具有闭环结构,半衰期与线性相比RNA长度;具有特殊的反向剪接位点(backsplice);机构表述不特异.疾病非特异性等;大多数有胞质;(CiRNA.EIciRNA)少数存在于核中;大部分是非编号;RNA,序列高度传统;整体表达丰度小于传统;mRNA;
环状RNA的种类
依据circRNA序列的起源,可以把circRNA分为四类:第一类是所有来自母基因外显子的显子circRNA(ExoniccircRNA,EciRNA);第二种是所有来自内含子的套索型circRNA(CircularintronicRNA,ciRNA);第三种来自外显子和内含子circRNA(Exon-introncircRNA,EIciRNA);第四种是来自反义链转录本的反义circRNA(AntisensecircularRNA).来自基因间序列或其他未注解基因组序列circRNA(Intergeniccircular)。绝大部分的circRNA属于外显子类型circRNA,保守类型circRNA也更高。
多种类型的circRNA
环状RNA关键生物学功能
1.miRNA海棉作用
根据碱基的互补配对,miRNA通过与靶基因中非翻译地区的融合,进而抑制或促进mRNA的翻译。RNA中间可以通过竞争融合在一起miRNA来危害miRNA对靶基因的抑制作用,这类RNA被称为竞争内源RNA(competingendogenousRNA,ceRNA)。研究发现,circRNA结构稳定,含量大miRNA回复原件可以作为高效的回复ceRNA,与miRNA融合,发挥miRNA海棉的作用,吸收miRNA,高效地抑止miRNA与靶基因非翻译区融合,从而达到对靶基因的调节效果。此外,还有一些,有些,circRNA也可以和多个miRNA整合,危害各种基因的控制。
2.作为翻译模板
circRNA缺乏帽子依赖感翻译的必要组成部分,如5`帽和polyA尾巴,因此,通常被认为没有翻译功能。但近年来,对于近几年来的工作,却被认为没有翻译功能。circRNA进一步研究,发现少数circRNA内核糖进入位点序列(IRES)它具有翻译水平,如circ-ZNF609,circMb1,circFBXW7,circPINTexon2和circ-SHPRH已被确认为蛋白质模板。
3.控制基因表达
有些CircRNA控制基因的转录可与转录因子融合。EciRNA它可以与细胞中一些蛋白质分子的特异性结合,作为脚手架(Scaffold)与RNA或DNA融合,为RNA结合蛋白(RBP).RNA.DNA中间互作提供平台。
CircRNA数据库