2022/09/15 / 公司活动及新闻
质粒DNA提取实验
质粒DNA提取实验
2022/09/15
质粒常用于我们的细胞实验DNA,现在使用剂盒非常方便,而且菌体培养后,可以多管浓缩提取,提到质粒量多,可以-20℃储存后用于酶切.转换等试验,可以提前跑胶,只要不降解,就可以继续使用,防止每次使用,都要再培养再提取。
质粒DNA的提取
质粒多为双链.环形的DNA分子独立于细菌染色体**以及遗传的辅助遗产**位置。质粒是生物学实验操作、遗传工程改良物种等最重要的工作DNA媒介。
实验步骤
1.摇菌培养
1)将鉴定测序正确的复制菌液涂涂抹LB固态平板。
2)置于37℃恒温培养箱,培养12-17h,待生长菌体。
3)杀菌15ml5加入离心管ml含抗生素的LB液体培养基,编号标记。
4)选择单克隆菌团放置液体培养基,每个培养液放置一个菌落。
5)37℃,180rpm,震荡训练过夜。
2.获得细菌并裂化
1)离心扩增菌液,按说明书将菌液重悬,转至1.5ml离心管内。
2)用少量质粒提取试剂盒,按说明书要求提取质粒。
3)细菌高速离心1min,完全去除上清。
4)加入250ulRB溶液,振荡器充分悬浮细菌。
5)加入250ulLB溶液。立即上下颠倒10次,使细菌裂化,室温,放置2次min。
6)加入250ulNB溶液。立即上下颠倒10次,使其充分中和,室温,放置2次min。
7)室温,1500rpm,高速离心15min。
8)将吸附柱放入收集管中,离心得到的上清转移到吸附柱、室温、1.5万rpm,高速离心30s。
9)废水,将吸附柱放入收集管中,加入700ulWB溶液进入吸附柱,1.5万rpm,高速离心30s。
10)重复上一个操作。
11)将吸附柱放入干净的1.5ml在离心管内,加30-50ul预热的ElutionBuffer,室温,放置2min,高速离心1min。
12)电泳检查样品:1%琼脂糖凝胶电泳,上样量为2ul,在紫外线下观察,最明亮的带是超螺旋,可以在一定程度上说明提取颗粒的纯度。
3.质粒的净化
1)将之前提取的质粒放入1.5ml3/10体积加入离心管mol/L无菌乙酸钠溶液。
2)加入2倍体积的无水乙醇,放置在-20℃沉淀4-6h或过夜。
3)4℃,高速离心机14000rpm,离心20min.
4)放弃上清,70%酒精洗两次。
5)空气干燥,可放置超净工作台干燥。
6)加200ul无菌水溶液干燥后得到沉淀,即质粒溶液。
7)紫外分光光度计测量质粒浓度和产量。
测量OD260和OD280的值:质粒DNA浓度=OD260×50×稀释倍数(μg/mL)。
10个常见问题
一.时间控制问题
裂化时间过长,加入溶液P2后裂化时间不得超过5分钟;吸附时间不足;溶解时间不足会导致质粒DNA提取试验失败。
二.大肠杆菌老化
建议涂层平板培养后再选择新菌体进行液体培养。
三.低质粒拷贝数
使用低拷贝数媒介引起的质粒DNA提取量低,可更换相同功能的高拷贝数媒体。
四.溶液使用不当
溶液P2.P3温度较低时可能出现混浊,应置于37℃保温片刻,直到溶解成清澈的溶液。
五.吸附柱过载
不同产品不同产品中的吸附能力不同。如果需要提取的质粒量很大,请分数次提取。如果使用聚集培养液,如聚集培养液,TB或是×YT必须减少菌液体积;如果质粒或宿主菌的拷贝数或生长率非常高,则需要调整LB培养液体体积。
六.质粒没有完全溶解
溶解质粒洗脱时,可适当加热或增加溶解时间。
七.酒精残留
漂洗液清洗后,尽量离心去除残留液体。树脂试剂盒漂洗后,树脂应干燥,然后倒入洗涤缓冲液中。
八.洗脱液位置不正确
洗脱液应加入硅胶膜中心,以确保洗脱液完全覆盖硅胶膜表面,达到最大的洗脱效率。
九.洗脱液不适合
DNA只能在低盐溶液中洗脱。洗脱效率取决于洗脱效率。pH值。最大洗脱效率在pH7.0~8.5间房间。用水洗脱时,其用水洗脱。pH如果值在这个范围内pH洗脱的概率太低。洗脱时,将杀菌蒸馏水或洗脱缓冲液加热至60%℃后用有利于提高洗脱效率。
十.洗脱体积太小
洗脱体积对来回收率